Mosaico sopra l’ingresso della chiesa
Sopra l’ingresso principale della chiesa si può vedere una mosaico che ritrae l’Annunciazione alla Vergine Maria, incastonato nella cornice barocca originale in stucco. Questo mosaico è stato realizzato nel 1971 e ha sostituito un dipinto precedente con lo stesso soggetto.
In origine, tuttavia, la facciata della chiesa era decorata da un’altra scena: l’apparizione di San Francesco d’Assisi a Porziuncola. Nel 1781 i frati decisero di sostituire l'immagine con la scena dell’Annunciazione, per farla meglio corrispondere alla dedicazione della chiesa.
Organo della chiesa
Le chiese cappuccine erano originariamente molto semplici, perciò a lungo mancavano gli organi e il coro. Lo stesso accadeva a Olomouc – ancora nel XVIII secolo, durante le celebrazioni, i frati prendevano in prestito organi portatili dalla chiesa di San Biagio.
La morte di San Francesco
La lunetta sopra la cappella laterale destra è decorata da un affresco che rappresenta la morte di San Francesco d’Assisi. Il santo giace umilmente a terra, circondato dai fratelli in preghiera – la scena sottolinea la sua povertà e semplicità.
La morte di San Giuseppe
La lunetta sopra la cappella laterale sinistra è decorata da un affresco che rappresenta la morte di San Giuseppe. Accanto al santo sono raffigurati da un lato Cristo, e dall’altro la Madonna insieme agli angeli
Affresco sull’arco trionfale
La grande superficie sopra l’altare maggiore è occupata da un dipinto murale con il motivo della crocifissione di Cristo. Al centro si trova la croce con Gesù, e sotto di essa la Madonna, San Giovanni Evangelista e Santa Maria Maddalena.
Stemma dell'Ordine francescano
La parte inferiore del pronao è decorata con il simbolo dell’ordine francescano. Al centro dell’emblema vi sono le braccia incrociate di Cristo e San Francesco d’Assisi, con il segno del chiodo sui palmi delle mani, e sullo sfondo la croce.
Via Crucis
Nella chiesa si trova un ciclo di dipinti della Via Crucis, realizzati dal pittore Adolf Rübenolt nel 1880. I dipinti raffigurano gli ultimi momenti della vita di Gesù Cristo
Pala dell’altare di San Francesco
Sopra l’altare della cappella destra si può vedere un dipinto di San Francesco d’Assisi, inginocchiato davanti ad un altare cosparso di rose. Davanti a lui appaiono Cristo con la croce e la Madonna.